Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms