Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG7O95352 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG7O95352 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG7O95352 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG7O95352 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms