Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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