Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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