Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBDO15205 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBDO15205 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms