Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms