Protein–RNA interactions for Protein: H3BQ06

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQ06 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
H3BQ06 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H3BQ06 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H3BQ06 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H3BQ06 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H3BQ06 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H3BQ06 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H3BQ06 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H3BQ06 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
H3BQ06 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BQ06 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
H3BQ06 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H3BQ06 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BQ06 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3BQ06 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3BQ06 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3BQ06 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3BQ06 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3BQ06 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3BQ06 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3BQ06 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H3BQ06 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3BQ06 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3BQ06 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3BQ06 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3BQ06 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms