Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms