Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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