Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms