Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX10Q9Y5X0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms