Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GIT1Q9Y2X7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms