Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms