Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms