Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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RABGEF1Q9UJ41 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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RABGEF1Q9UJ41 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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RABGEF1Q9UJ41 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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RABGEF1Q9UJ41 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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RABGEF1Q9UJ41 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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RABGEF1Q9UJ41 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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RABGEF1Q9UJ41 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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RABGEF1Q9UJ41 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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