Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRP2BPQ9P2M1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms