Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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