Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms