Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CMTM6Q9NX76 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms