Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms