Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7BQ9NP56 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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