Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCC2Q9HCC0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms