Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms