Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms