Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms