Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TINF2Q9BSI4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms