Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms