Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms