Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms