Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYTL4Q96C24 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms