Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms