Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms