Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms