Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms