Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms