Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNAAF3Q8N9W5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms