Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms