Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms