Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1N4

KRT78, Keratin, type II cytoskeletal 78, humanhuman

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT78Q8N1N4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT78Q8N1N4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT78Q8N1N4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT78Q8N1N4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT78Q8N1N4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT78Q8N1N4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT78Q8N1N4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT78Q8N1N4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT78Q8N1N4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT78Q8N1N4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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KRT78Q8N1N4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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KRT78Q8N1N4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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KRT78Q8N1N4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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KRT78Q8N1N4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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KRT78Q8N1N4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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KRT78Q8N1N4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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KRT78Q8N1N4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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KRT78Q8N1N4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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