Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PLD3Q8IV08 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PLD3Q8IV08 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PLD3Q8IV08 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PLD3Q8IV08 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PLD3Q8IV08 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PLD3Q8IV08 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PLD3Q8IV08 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PLD3Q8IV08 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PLD3Q8IV08 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PLD3Q8IV08 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PLD3Q8IV08 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PLD3Q8IV08 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PLD3Q8IV08 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PLD3Q8IV08 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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PLD3Q8IV08 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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