Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms