Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms