Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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