Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC174Q6PII3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms