Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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