Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms