Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP4R4Q6NUP7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms