Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms