Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms