Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms